一航归家不久，祖父卓仲廉因禁受不了丧子之痛而身亡，不久卓一航也被人陷害而坐牢，练霓裳闻讯后前来相救。劫狱后练霓裳遭遇武林大豪铁飞龙，两人误斗一场而后练认其为义父。武当掌‘门’紫阳道长逝世，遗命卓一航为继任掌‘门’，一众武当同‘门’在铁飞龙家中与练相遇，练霓裳再败卓的师叔红云道长，双方梁子越来越深。卓一航陷入苦恼之中，推托要守孝申冤，缓任三年。安葬师父之后，卓一航与师叔白石道长一同北上申冤。遇岳鸣柯与河南嵩山，两人引为知‘交’。
岳鸣柯应熊廷弼之命自陕赴京，途中与黑道高手“‘阴’风毒砂掌”金独异遭遇，一场恶斗，岳中毒受伤，幸得铁飞龙之‘女’铁珊瑚相救，两人心中滋生柔情，同赴北京。进京后适逢即位不久的光宗朱常洛误食“红丸”而架崩。熹宗朱由校即位，太监魏忠贤和由校‘乳’娘客氏挟天子以令群臣。熊廷弼甫抵京就被矫旨捉拿并屡遇险情，幸得岳鸣柯、卓一航、练霓裳、铁飞龙等相救才得以脱险。而这时金独异之妻红‘花’鬼母出山约战铁飞龙，练霓裳凭机智、武功击败了红‘花’鬼母，金独异也再次受到重伤。熊廷弼辞官瑟岳鸣柯、卓一航及其师叔白石道长离京回湖北，练霓裳与铁飞龙随后赶到嵩山相遇。白石和红云道长阻止练与卓一航会面，双方狠斗一场，白石道长等再次败退，双方积怨更深。卓一航回家守孝，练霓裳闻知朝廷大军到陕西剿匪，急急赶回。途中遇闯王李自成，获知自己的山寨已被官军攻破，余部逃入四川。旋即入川聚集旧部，与铁珊瑚一道在广元明月峡再立山头。此后，朝廷重新启用熊廷弼任辽东经略使，但实权旁落，部下不听指挥而轻敌冒进，导致全军覆没。魏忠贤借机杀死了熊廷弼，派锦衣卫缉拿岳鸣柯，岳鸣柯只身逃往四川，在广元遇到卓一航、练霓裳相救而脱险。
卓一航守孝三年期满，其师叔红云、白石道长率众弟子入陕迎接新任掌‘门’。途经广元，‘玉’罗刹将卓一航“劫”至明月峡山寨，并表明了心迹，要与卓一航合籍双修，同研武功。卓一航碍于师‘门’偏见，一时不敢答应。气量狭窄的白石、红云道长，为找回卓一航并报复‘玉’罗刹，与官兵联手攻破明月峡，纵火焚毁山寨。寨中‘女’兵几乎全部战死，铁珊瑚也死在金独异之手。岳鸣柯杀死金独异之后远走天山，出家为僧，法名晦明禅师，‘精’研武功，成为开创天山派一代宗师。练霓裳与铁飞龙再度赴京，将岳鸣柯冒死带出的能廷弼兵书《辽东论》转送给边关大战袁崇焕。卓一航托人稍信给练霓裳，极表爱恋之意，练霓
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