提督嘉峪关以西的军政要务，镇守敦煌、瓜州、哈密卫、安西、玉门等地。
这些地方基本都是金国新得之地，原来被吐鲁番和蒙古人控制，势力盘根错节，而且信仰复杂，有信仰绿教的，也有信仰黄教的，还有胡化的汉人，很难控制。
孙可望到了关西之后，将驻节之地放在了瓜州，便开始治理这关西数百里之地。
孙可望打仗不行，内政却是一把好手，他到了瓜州之后，首先就将黄教的几个仁波切，赶回了藏区，然后又打压绿教，规定河西走廊上的汉、蒙、回、藏四民，都必须遵守金国的法令，各教派不得私收赋税和要求信徒捐献，另外河西走廊所有的居民，都必须向金国纳税。
他这样搞，自然引起了宗教和一些大部落的不满，可是孙可望最擅长的就是吃大户，打土豪。
孙可望不怕他们闹事，就怕他们不出声，一旦他们闹事，他就有了动武的借口，而一旦动武，那他就会要钱有钱，要粮有粮，能够在河西走廊打开局面。
他这招如果在关中用，肯定会被韩朝宣等汉族大臣喷死，欲杀之而后快，可他在河西走廊上搞，却没有影响到汉族士绅的利益，所以并没有多少人反对。
孙可望以雷霆手段，剿灭了两个不服的部落，然后又杀了几个宗教首领，一改当初豪格宽松的宗教政策，以狠辣的手段震慑住了河西诸部，将原本松散的河西之地，慢慢整合起来。
等到初步整合之后，孙可望便开始一面恢复畜牧业，将一些不服教化的部落首领和宗教领袖的资产，主要是牛羊和马匹，分给牧民放养，然后与牧民平分收获，使得牧民的积极性大大提高。
另外，他还开设边市，同蒙古人、藏区，甚至和叶尔羌进行贸易，积蓄财富，使得金国对河西的控制显著加强，连韩朝宣、孔闻褾等人对他的看法都有所改观。
瓜州，如今就是整个河西走廊上一个重要的物资集散之地，孙可望在这里开设了一个集市，四周的牧民和商人都慕名而来，使得瓜州比之以前，繁华了几倍。
孙可望十分重视集市，关中的茶叶、布匹、瓷器等货物运送到此，换取了牛羊毛皮，甚至马匹，然后又运回关中。
这一来一回就能赚个几倍，巨大的利益促使更多的关中商人过来，这不仅给孙可望带来赋税，同时也改变了关中士绅对他的映象，觉得这个泥腿子出身的杀人魔王，或许还有些用处。
原本松散的河西之地，在他的经营下，似乎有了点丝绸之路的味道。
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