几人也分道扬镳了。猪鹿蝶三人当然是要回到木叶，而他们也知道夜吹雪因为某些原因还不能在木叶呆太久，也就没有让夜吹雪回木叶看看的意思，只是在言语中表达出了会照顾水门的儿子鸣人的意思，让夜吹雪不要担心。
在几人离开了之后，夜吹雪马上书写了几遍关于神秘敌人的资料，分别用隐秘的手法送到了雾忍村小美的手中，还有音忍村的基地之中。其实夜吹雪在与猪鹿蝶三人交谈的时候隐瞒了一个信息，那就是在西村上野那里，夜吹雪得知了关于神秘敌人其他几个基地的位置了资料。
当初被千叶博士影子通灵兽变成一样奇怪的影子通灵兽的一共有九个人，其中三个人已经被夜吹雪等人消灭了，剩下三人的情报也有了眉目，夜吹雪当然不会放过这个机会把他们一网打尽。虽然还不知道幕后黑手，所谓“千叶大人”的具体位置，但是先清除它的爪牙无疑是最好的选择。
至于为什么不把敌人的基地位置告诉猪鹿蝶三人，其实夜吹雪也有自己的算计，那就是消灭了敌人之后那强大的精神力结晶。影子通灵兽企图称霸整个世界，当然会不断的收集人的灵魂，或者说是精神力，而这种方法，夜吹雪等人可不具备。
水门的灵魂因为使用封印术而变得残破，所以才陷入了假死。而夜吹雪感觉，他得到的那奇怪的精神力晶体，应该不仅仅能让人吸收，更是能补全水门的精神力。就算不能把这精神力吸收，或者救活水门，就算用来做实验，也是非常不错的选择。
所以剩余的影子通灵兽基地，夜吹雪都要亲自去消灭掉，并且吸收他们的精神力结晶。一方面不让他们的势力，所谓“千叶大人”的实力更强，另一方面也是为了自己这一方。此时整个忍者界都知道了关于忍者失踪案件后面有阴谋，所以多加防范，影子通灵兽要收集忍者的灵魂无疑会十分的困难，而这个时候正是打落水狗的最好时机。
当夜吹雪回到了音忍村之后，马上开始着手清理影子通灵兽的分基地，去除他们的爪牙。就这样，不知不觉的已经过了一年的时间，这一年中，夜吹雪分别把剩余的六个分基地的干部一网打尽。虽然他们因为长山岗，水旅花田还有西村上野被消灭的事件后都有所防范，不过夜吹雪已经知道了他们的弱点，不会让他们逃走了。
也是因为了有了防范，所以有的时候夜吹雪按照西村上野留下情报的地方赶去的之后，发现却是一个空的基地，再次查找才找出此时的基地位置，所以才耽误了整整一年的时间。而在战斗中，他们没有一个像西村
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