夏和胃止呕、健脾除湿，白术、党参补气健脾、和胃除湿，甘草调和诸药。研究发现，香砂六君子丸对胃黏膜充血和水肿等病理变化均有明显抑制作用，可减少上皮化生及炎性细胞浸润，进而减轻胃黏膜慢性损伤，此外还可改善胃肠道的内分泌功能，调节细胞免疫及体液免疫功能。动物试验也发现，香砂六君子丸可显著提高脾虚胃溃疡大鼠超氧化物歧化酶（SOD） 活性，同时降低脂质过氧化产物丙二醛（MDA） 含量，降低胃蛋白酶活性，具有抗溃疡作用。
香砂六君子丸治疗消化性溃疡，能提高幽门螺杆菌（Hp）根除率、溃疡愈合质量，改善临床症。
糖尿病性胃轻瘫：
香砂六君子丸出自《太平惠民和剂局方》，广泛用于脾胃病的治疗。方中党参补脾益气为主药；辅白术健脾燥湿，扶助运化；配茯苓甘淡渗湿，健脾和胃；陈皮、木香行气止痛；半夏燥湿化痰；砂仁健脾化湿，温中止呕；炙甘草甘温益气，并助诸药达补气健脾之功。诸药合用，补而不滞，温而不燥，消除痰湿停留，促进脾胃运化，是治疗脾胃病尤其是脾气亏虚证的要方。
现代药理研究表明，香砂六君子丸能抑制胃黏膜水肿，充血及瘀血等病变，减轻细胞浸润及腺体增生性改变，能明显减少肠上皮化生的发生；能抑制胃酸及胃蛋白酶分泌，可使胃壁结合黏液量增加，延缓氢离子自胃腔向黏膜内的弥散，并阻止碳酸氢盐自上皮细胞表面向胃腔内的移行，从而保护胃黏膜，使其免受损伤。药理学离体大鼠实验表明，香砂六君子丸对胃底有兴奋作用，对胃体、胃窦、幽门有抑制作用，能增高胃底肌条的张力，减弱胃体、胃窦肌条的收缩波平均振幅及幽门环行肌条的运动指数。且香砂六君子丸各组成部分对胃肠道、血糖等有调节作用。
香砂六君子丸治疗糖尿病性胃轻瘫，能有效改善患者胃排空时间和临床症状。
胃肠功能障碍：
香砂六君子丸由人参、白术、茯苓、甘草、陈皮、半夏、砂仁、木香组成。是在四君子汤补气健脾的基础上加用行气止痛、化痰燥湿药，以达益气健脾、行气化痰之功。四君子汤方中人参甘温补脾益气，为君药；臣以白术健脾燥湿，扶助运化；配以茯苓甘淡渗湿，为佐药；甘草甘缓和中，胃气得安，为使药；四药合用，温而不燥，补而不滞。加陈皮、半夏理气健脾、化痰燥湿，木香行三焦之气，砂仁化湿醒脾、温中止呕。诸药合用，能健脾化湿、和胃畅中。
香砂六君子丸可促进蛋白质的合成和改善营养状况
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