牛膝，也可以配伍应用。如《肘后方》治疗口中及舌上生疮，用牛膝一味酒渍或空含咽即效。《本草纲目》治喉痹、乳蛾，用新鲜牛膝根一握，艾叶七片，捣和人乳，取汁灌入鼻内，须臾痰涎从口鼻出，且“无艾亦可”。如果配伍黄连、丹皮、当归、生地，对于导头面之火热下行，效果更佳，如加味清胃散。
上溢之血本品苦泄下降，能引血下行，以降上炎之火，故可治血热妄行之吐血、衄血，常与白茅根、小蓟、侧柏叶、栀子等同用；如果是阴虚火旺所致的齿衄，可以配伍石膏、生地、麦冬、知母等同用，即玉女煎。
肝阳之风牛膝能引血下行，使浮越之亢阳下潜，常与赭石、生牡蛎、生龟甲等配伍，即张锡纯先生的镇肝熄风汤。
引药下行是牛膝的另一重要功效，最早提出这一观点的是朱丹溪，他在《本草衍义补遗》中说：“牛膝能引诸药下行，筋骨痛风在下者，宜加用之。其性虽下行走筋，然滑利之品，精气不固者，终非所宜。得酒蒸则能养筋，生用则去恶血。其治腰膝痛不可屈伸足痿之病，非取其养血营筋之力。”自此之后，临床医家对于腰膝以下疾病多以之作为引经之药。
至民国张锡纯对此理解更深，他说：“牛膝原为补益之品，而善引血下注，是以用药欲其下行者，恒以之为引经。故善治肾虚腰疼腿疼，或膝疼不能屈伸，或腿痿不能任地。兼治女子月闭血枯，催生下胎，又善治淋痛，通利小便，此皆其力善下行之效也。……愚因悟得此理，用以治脑充血证，伍以赭石、龙骨、牡蛎诸重坠收敛之品，莫不随手奏效，治愈者不胜记矣。”
根据牛膝的下行作用，凡腰膝以下病变皆可用牛膝作为首选之药，在某些地区甚至有“无牛膝不过膝”之说，意即如果不配伍牛膝，则方剂的药效作用达不到膝关节以下，此语虽说过于武断牵强，但也体现出医者对其引药下行功效的重视。
治疗腰部以下，尤其是膝关节以下病变，常常有意识地配伍本品以引药下行。如对于风湿痹痛、跌打损伤、瘀血阻滞引起的下肢疼痛、麻木、冷感等，常在辨证方药中加入牛膝而取效。
牛膝常用量为10~15克，据临床需要可以增加剂量。中气下陷，脾虚泄泻，下元不固，梦遗失精，月经过多者不宜，由于其有动胎之力，故孕妇忌用。
牛膝虽有怀牛膝与川牛膝两种，而且两种也都是苋科植物，但是二者还是有一定区分的。严格来说，怀牛膝是正品，而川牛膝为副品。牛膝很早就被载入到本草书中，但是唐代以前记载的
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