他也知道陕地新军初练，不可轻动，应当慎重行事。
兵部尚书陈新甲也力主孙传庭不可轻动，他陈述利害，指明孙传庭在陕西不动的话，流贼北上南下都有后顾之忧，若孙部脱离潼关，孤军深入，一旦不测，后果不堪设想。
他指责那些叫嚣孙部出兵的陕西籍官员是以邻为壑，多个朝臣赞同陈新甲的看法。
严重分歧下，崇祯皇帝更是迟疑，他虽说有孙部出关后一鼓歼灭流贼的幻想，也知道目前流贼势大难敌，应该多给时间让孙传庭练兵储饷，加强实力。
同时有人弹劾督师侯恂到开封后一事无成，畏敌避战，致使流贼又围开封。
想起督师侯恂，崇祯皇帝也有些恨恨：“无能之辈！”
崇祯帝之所以启用侯恂，一是因为侯恂是河南归德府人，对河南情况比较了解，二是因为侯恂对左良玉有恩，可以笼络当时兵多势重的左良玉部。
现在左良玉身死，平贼镇灰飞烟灭，侯恂到开封后，也只上了一个方略奏疏，主张陕西、保定、山东、凤阳、湖广、淮徐各督抚固守本境，断贼奔逸之路，他自己坐镇开封，相机行事，最好让流贼饿死在河南。
奏疏说得好，然本质是杨嗣昌“十面张网”的翻版，流贼也不会象侯恂想的那样，一厢情愿蹲在河南挨饿。
而且这奏疏还看出侯恂的私心，各地督抚若防堵失败，势必成为他侯恂的替罪羊，这更让崇祯帝不喜，认为侯恂是狡黠之辈，有负自己重托。
侯恂到开封也有一段时间了，如今一事无成不说，还让开封又被围困，这让崇祯帝对侯恂越加不满。
有朝臣认为应以孙传庭替换侯恂为督师，总督保定、山东、河北各处军务，全盘掌控剿贼事宜，崇祯帝有些心动，他太需要一个有能力的大臣出任督师，组织有效的堵剿了。
孙传庭一看就比侯恂这个无能之辈强多了，特别潼关大捷的消息传来之后。
不过他还是按捺住了，此时开封又被围困，大敌当前，更换侯恂只会让开封府城产生不必要的动荡，要换侯恂，也只会在孙传庭兵成，又解开封之围后。
开封必须救援，然大明无可用兵马，崇祯帝想来想去，除传旨让孙传庭加紧练兵外，只得晓谕河南等各处组织团练，对结寨自雄的地主武装赦罪录功，希望这些兵马多少能解开封之围。
此时河南各处土贼拥起，如刘洪起据汝宁，韩甲第据许州，李际遇据登封，李好据裕州，刘铉据襄城，分辖各数百里，拥众各十余
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