准备对孙权展开攻势，司马懿则被升任抚军大将军，持有皇帝三级符节——假节，领兵五千人镇守陪都许昌，同时又享受到了实际上的国务院总理待遇——督后台文书。司马懿虽然也喜欢升官儿，但是自己都觉得这么快升迁太招人眼热，就不肯就职，曹丕语重心长的教导他：“我天天处理这些杂事，没白天没黑夜，连休息日都没有，我让你当总理不是给你升官，是让你多替我干活哪！”
曹丕大举进攻东吴，临走的时候，跟司马懿说：“你看家看的好，我才能打胜仗。好好给我看家吧，这是最重要的责任！”曹丕走了以后，司马懿既负责内政、又负责供应前方军事物资，曹丕回师首都洛阳，又给司马懿写下诏书说：“以后我东征，你就在西面看家；我西征，你就在东面看家。”于是司马懿继续留守仅次于首都洛阳的陪都许昌，我们可以看出来，现在的司马懿已经不仅仅是独当一面了，而是成为了曹丕的大内总管。
然而就在公元226年5月，仅仅40岁的曹丕就得了暴病，很快就病危了。临死的时侯，他把抚军大将军司马懿和另外三个一品大将军——中军大将军曹真、镇军大将军陈群、征东大将军曹休同时任命为为辅政大臣，负责辅佐当时只有22岁的太子曹睿。临死前，曹丕还特别对曹睿说：“以后如果有人说这几个人的坏话，你绝对不要相信。”
曹睿即位之后，司马懿被改封为舞阳侯。8月，南方的孙权知道曹丕去世，分两路大举进攻曹魏帝国，司马懿和另一位辅政大臣曹真配合，分别击退孙权的进攻。12月，司马懿因为战功显赫，由抚军大将军再升为骠骑大将军。公元227年6月，司马懿被任命为都督荆州、豫州军事（湖北、中原军区总司令），驻扎在宛城(河南南阳)，从此正式开始了他作为大军区司令南征北战的漫漫生涯。
就在司马懿刚刚上任的时候，蜀汉帝国的实际领导人诸葛亮已经在汉中集结大军，准备对曹魏帝国展开全面攻击，在诸葛亮发动进攻之前，他联络了原先背叛了蜀汉帝国的新城太守（湖北房县）孟达，重新效忠蜀汉，孟达虽然答应，但迟迟犹豫不决，不敢立刻起兵。司马懿知道孟达将要背叛，一面写信好言安抚，一面立刻带人从宛城急行军打了过去。当时，宛城距离新城足足有六百公里，而且途中大半都是山路，非常不好走，孟达非常坚信司马懿不可能亲自来，他的部队也不可能那么快就到，可是，八天之后，司马懿领着大军已经到达新城，十六天之后，就把新城攻了下来。
孟达被杀以后，诸葛亮联合孟达起
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